港澳地区在内地合作办学的高校主要有以下几所：
北京师范大学-香港浸会大学联合国际学院：简称“北师港浸大”，位于珠海市，是中国内地与香港高等教育界合作创办的首家大学，也是内地第一所新型博雅大学。学校设有多个学院和系，在约30个本科专业（方向）招生，并开设研究型和授课型研究生专业，在校生逾9000人。
香港中文大学（深圳）：位于深圳市，采用理事会领导下的校长负责制，中、英双语教学，实行书院制度。学校设有多个学院和一个研究生院，开设了多个本科专业和研究型、授课型研究生专业，已与多所境外名校开展实质性交流与合作。
香港科技大学（广州）：位于广州市南沙区，是一所内地与香港合作举办的公立大学。学校采用全英文授课，对学生英语单科成绩有一定要求，按大类培养，学生入学后前两年不分专业，大二结束时进行专业选择。
香港城市大学（东莞）：位于东莞市松山湖科学城内，将建设为国际性一流水平的大学。学校教学管理按照香港城市大学的教学质量监督体系以及评核标准，确保两所学校办学质量一致。
此外，正在筹建的港澳高校在内地合作办学机构还有香港大学（深圳）、香港都会大学（肇庆）、澳门科技大学珠海校区、澳门科技大学（中山）、澳门城市大学（广州）等。
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